Se integra por nueve miembros y será elegida de entre los integrantes de la Coordinadora Ciudadano Nacional. Son atribuciones y facultades de la Comisión Operativa Nacional: Ejercer las representación política y legal de Movimiento Ciudadano en todo tipo de asuntos de carácter judicial, político, electoral, administrativo, patrimonial y para delegar poderes y/o establecer convenios en los marcos de la legislación vigente.